Desa Banagan memiliki beberapa potensi unggulan, antara lain:
- Pertanian: Produk utama adalah padi, jagung, dan singkong.
- Perikanan: Sungai desa menjadi sumber ikan air tawar yang dikelola secara lestari.
- Pariwisata: Wisata alam seperti kawasan perbukitan, area pertanian hijau, dan lokasi budaya untuk wisata sejarah.
- Produk Lokal: Kerajinan tangan dari bambu dan rotan yang dihasilkan oleh warga.